12.1 Step by step
To use SciServer, you first have to go to http://www.sciserver.org/ then click on “Login to SciServer”. If you are a first time user, click on “Register New Account” and enter the information they request as shown on Figure .
Figure 3: SIgn up to SciServer
Once you’ve registered, open the SciServer compute tool (see Figure ).
Figure 4: Click on SciServer Compute,
Then click on “Create container”, choose a name of your preference and make sure that you choose to load R 3.3.x and the public volume (see Figure ). This will enable you to access all of the data as if it was on your computer. Click “Create” once you are ready.
Figure 5: Select the appropriate image and load the recount public volume
Once you have a container, create a new R Notebook as shown in Figure .
Figure 6: Create a R notebook
In this R Notebook you can insert new code cells where you can type R code. For example, you can install recount and DESeq2 to run the code example from this vignette. You first have to install the packages as shown in Figure .
Figure 7: Install recount and DESeq2 on SciServer
Then, the main part when using SciServer is to use to remember that all the data is available locally. So instead of using , you can simply use with the correct path as shown in Figure .
Figure 8: recount files are available locally so remmeber to use the local data when working on SciServer
Several functions in the recount package have the argument, which you can specify to use the data locally. Try using in SciServer to get started with the following code:
5.2 Compute coverage matrix
Having defined the expressed regions, we can now compute a coverage matrix for these regions. We can do so using the function from recount as shown below. It returns a RangedSummarizedExperiment object.
The resulting count matrix has one row per region and one column per sample. The counts correspond to the number (or fraction) of reads overlapping the regions and are scaled by default to a library size of 40 million reads. For some differential expression methods, you might have to round this matrix into integers. We’ll use DESeq2 to identify which expressed regions are differentially expressed.
6.1 Using another/newer annotation
If you are interested in using another annotation based on hg38 coordinates you can do so using the function or by running bwtool thanks to the BigWig files in , in which case recount.bwtool will be helpful.
If you are re-processing a small set of samples, it simply might be easier to use as shown below using the annotation information provided by the EnsDb.Hsapiens.v79 package.
The above solution works well for a small set of samples. However, is faster for processing large sets. You can see how we used at leekgroup/recount-website. It’s much faster than R and the small package recount.bwtool will be helpful for such scenarios. Note that you will need to run after using and that will have to download the BigWig files first unless you are working at JHPCE or SciServer. will download the files for you, but that till take time.
Включение аддона в игре
Аддоны в игре World of Warcraft предназначены для облегчения игрового процесса и обеспечения дополнительной информации. Для использования аддона в игре необходимо его включить.
Для этого вам необходимо:
- Зайти в игру и перейти в главное меню;
- Открыть раздел «AddOns»;
- В списке найдите нужный аддон и поставьте напротив него галочку;
- Перезапустите игру, чтобы изменения вступили в силу.
Если после перезапуска аддон не появился в игре, то возможно вы выбрали неправильный путь до папки с аддонами. Уточните правильный путь к папке с аддонами, измените его в настройках игры и повторите процедуру включения аддона.
После включения аддона он будет доступен в игре и вы сможете наслаждаться его функционалом.
English[edit]
Etymology 1edit
From Old Northern French and Anglo-Norman , variant of Old French .
- IPA(key): /ɹɪˈkaʊnt/
-
Audio (Berkshire) (file) - Rhymes: -aʊnt
Nounedit
recount (plural )
- Narration, account, description, rendering
Translationsedit
narration, description
|
Verbedit
recount (third-person singular simple present , present participle , simple past and past participle )
- To tell; narrate; to relate in detail
- The old man recounted the tale of how he caught the big fish.
-
() To rehearse; to enumerate.
- to recount one’s blessings
Translationsedit
to tell, narrate
|
Etymology 2edit
From + .
Nounedit
recount (plural )
- A counting again, as of votes.
Translationsedit
counting again
|
Verbedit
recount (third-person singular simple present , present participle , simple past and past participle )
- To count again.
Translationsedit
to count again
|
Скачать Recount
| Ссылка на скачивание | Последнее обновление |
| 31.08.2019 | |
| 27.06.2019 | |
| 13.03.2019 | |
| 14.12.2018 | |
| 12.07.2018 | |
| 26.02.2018 | |
| 04.09.2017 | |
| 08.07.2017 |
| Скачать для предыдущих версий игры | ||
| 6.2.3 | 5.4.8 | |
| 4.3.4 | 3.3.5 | 2.4.3 |
Skada Damage Meter: статистика урона и хила
GTFO: аддон для звуковых оповещений игрока
WeakAuras 2: аддон для оповещения спелов и проков
Показывающий боевую статистику (ДПС, ХПС и т.д.) в графическом виде. Recount появился в далеком 2007 году. С тех пор внешне он не сильно изменился, что свидетельствует о простоте и полезности этого аддона.
Я расскажу Вам как скачать, установить и настроить Recount. Кроме того отвечу на самые часто задаваемые вопросы, связанные с Рекаунтом.
Установка Recount:
Как и большинство аддонов для WOW — Recount очень прост в установке:
1. Скачайте и разархивируйте архив с аддоном ( для любой версии WoW можно на этой странице).
2. Теперь скачанную папку с аддоном необходимо скопировать в папку: «World of Warcraft/Interface/Addons». Файлы аддоны должны лежать по такому пути, как указан на скриншоте:
3. Запустите клиент WoW (или перезапустите, если он был запущен). В окне выбора персонажа нажмите кнопку «Модификации»:
4. В появившемся списке установленных аддонов отметьте галочкой Рекаунт:
5. Сохраните и зайдите персонажем в игровой мир. Если Вы все сделали правильно, то сразу после входа появится главное окно рекаунта по центру экрана. если оно не появилось, попробуйте ввести команду «/recount show».
Окошко рекаунта можно перетащить в любое место на экране. Лучше переместить его туда, где оно не будет Вам мешать и закрывать обзор. Кроме того, потянув за края, можно отрегулировать окошко по высоте и ширине.
На этом установка окончена.
Настройка и использование Recount:
Вообще говоря, установленный рекаунт сразу после установки, готов к использованию. Если Вы начнете наносить ДПС, то увидите соответствующую информацию в главном окне рекаунта.
Кроме ДПС, рекаунт может показывать еще много полезной информации. Для этого нажмите правой кнопкой мыши по надписи «Нанесенный урон» в верхней части главного окна и выберите нужный вид статистики:
Самые важные показатели — это УВС (урон в секунду, он же ДПС или DPS), нанесенный урони эффективное исцеление. К примеру, если Вы играете Лекарем, то для Вас будет интереснее узнать о количестве эффективного исцеления, нежели о ДПС.
Чтобы показать статистику другим игрокам, нажмите на кнопку «Отчет данных», находящуюся в верхней части главного окна аддона:
Для того, чтобы узнать более подробную статистику о нанесенном уроне, просто нажмите на строчку с вашим именем в окне Recount:
Часто задаваемые вопросы (FAQ):
-
Вопрос:
Я не вижу recount после установки, что делать?
-
Ответ:
Попробуйте ввести команды /recount show или /recount resetpos. Если это не помогло, тогда удалите все файлы Recount.lua в папке WTF.
-
Вопрос:
Не вижу детальной статистики, когда нажимаю на строку в рекаунте. Как это исправить? -
Ответ:
Воспользуйтесь командой /recount resetpos.
-
Вопрос:
Почему я не вижу статистики по моим петам (тотемам)? -
Ответ:
Зайдите в настройки рекаунта (команда /recount resetpos, или кнопка колесика на окне аддона) и снимите галочку «Объединять питомцев с хозяином».
Установка аддона
Для установки аддона Wow recount необходимо выполнить несколько простых шагов. Сначала необходимо скачать аддон с официального сайта World of Warcraft или с других соответствующих сайтов. Затем необходимо открыть папку с игрой и найти папку Interface.
Внутри папки Interface необходимо создать новую папку с названием AddOns. В эту папку следует распаковать скачанный архив с аддоном. После этого необходимо перезапустить игру, чтобы аддон был загружен.
Чтобы убедиться, что аддон успешно установлен, можно проверить список аддонов в меню Addons, которое находится в главном меню игры. Если аддон присутствует в списке, то он был успешно установлен и готов к использованию в игре.
Теперь Вы можете насладиться всеми преимуществами аддона Wow recount и отслеживать статистику своих боевых действий в режиме реального времени.
Основные функции аддона Wow recount
1. Подсчет урона. Одной из главных функций аддона является подсчет урона, который вы и ваша группа могут наносить врагам. ReCount подсчитывает все типы урона — физический, магический, отравление, огонь и многое другое. Это позволяет вам понимать, какой тип урона наиболее эффективен при сражении с определенным типом врагов.
2. Анализ логов боя. Wow recount собирает данные в реальном времени, позволяя вам анализировать действия вашей группы и определять слабые места, которые можно улучшить. Вы можете просмотреть историю боя, чтобы понять, какие действия привели к победе или поражению.
3. Статистика онлайн. Аддон ReCount позволяет просматривать статистику во время боя, что помогает вам быстро адаптироваться к стратегическим изменениям в битве. Вы можете просматривать, какой урон получают ваша группа и враги, какую эффективность имеют таланты вашей группы и т.п.
4. Сравнение производительности. Wow recount также позволяет сравнить производительность игроков в вашей группе, что помогает понимать, какие члены группы привносят больший вклад в сражении. Вы можете просмотреть, кто наносит больший урон, кто исцеляет больше, кто тратит меньше времени на восстановление во время боя и т.д.
Отображение данных аддона
После того, как вы успешно включили аддон Wow recount, вы можете начать отображать данные. Как только вы начинаете играть, аддон автоматически начинает собирать информацию о вашей команде, включая нанесенный урон, полученный урон и излечение.
Чтобы отобразить данные аддона в игре, вам нужно нажать на соответствующую кнопку в вашем интерфейсе. Обычно это выглядит как небольшой символ, которому соответствует название аддона. После того, как вы нажмете на эту кнопку, откроется окно с подробной информацией о вашей команде.
Данные аддона могут отображаться в нескольких форматах, включая числовые таблицы и графики. Вы можете настроить аддон таким образом, чтобы он показывал информацию только об определенных параметрах, например, уроне.
Кроме того, данные аддона можно экспортировать в форматах CSV и HTML, чтобы обрабатывать и анализировать их в других программах. Это может быть полезно для тех, кто хочет более детально изучить информацию о своей команде и выявить области, в которых они могут улучшить свою игру.
- Кнопка для отображения данных аддона находится в вашем интерфейсе
- Данные могут быть представлены в виде числовых таблиц и графиков
- Вы можете настроить аддон на отображение информации только об определенных параметрах
- Данные аддона можно экспортировать в форматах CSV и HTML
1.2 Required knowledge
recount is based on many other packages and in particular in those that have implemented the infrastructure needed for dealing with RNA-seq data. That is, packages like GenomicFeatures and rtracklayer that allow you to import the data. A recount user is not expected to deal with those packages directly but will need to be familiar with SummarizedExperiment to understand the results recount generates. It might also prove to be highly beneficial to check the
- DESeq2 package for performing differential expression analysis with the RangedSummarizedExperiment objects,
- DEFormats package for switching the objects to those used by other differential expression packages such as edgeR,
- derfinder package for performing annotation-agnostic differential expression analysis.
4.4 DE analysis
The recount project records the sum of the base level coverage for each gene (or exon). These raw counts have to be scaled and there are several ways in which you can choose to do so. The function helps you scale them in a way that is tailored to Rail-RNA output. If you prefer read counts without scaling, check the function . Below we show some of the differences.
We are almost ready to perform our differential expression analysis. Lets just add the information we recovered GEO about these samples.
Now that the RangedSummarizedExperiment is complete, we can use DESeq2 or another package to perform the differential expression test. Note that you can use DEFormats for switching between formats if you want to use another package, like edgeR.
In this particular analysis, we’ll test whether there is a group difference adjusting for the gene target.
We can now use functions from DESeq2 to explore the results. For more details check the DESeq2 vignette. For example, we can make a MA plot as shown in Figure .
Скачивание аддона
Перед тем, как начать использовать аддон Wow recount, нужно его скачать. Скачать аддон можно с официального сайта игры или через специальные сайты для скачивания аддонов.
На официальном сайте игры Warcraft есть раздел «Дополнения», где можно найти и скачать аддоны. Для этого нужно зайти на сайт, нажать на раздел «Дополнения» и выбрать искомый аддон. После этого нужно нажать на кнопку «Скачать», установить аддон и перезапустить игру.
Также можно скачать аддон Wow recount через специальные сайты для скачивания аддонов, такие как Curse, WoWInterface и другие. Для этого нужно зайти на сайт, найти искомый аддон, нажать на кнопку «Скачать» и установить аддон в папку с игрой. После установки аддона и перезапуска игры он будет готов к использованию.
Но не стоит забывать, что использование аддонов может повлиять на производительность игры и безопасность компьютера. Поэтому перед установкой аддона рекомендуется ознакомиться с отзывами и рейтингами на специальных сайтах.
